学校始于1927年3月陶行知先生创办的晓庄试验乡村师范学校；2000年3月，原南京师范专科学校、南京教育学院、南京市晓庄师范学校合并组建成为南京晓庄学院；2014年，南京幼儿高等师范学校并入。
截至2017年9月，学校方山、莫愁两个校区，校园面积近1500亩；学校现有教职工1265人，其中高级职称教师460人，博士学位者276人；另有兼职教师200余人、境外教师近20人，柔性引进学科带头人10余人。全日制本科在籍学生18200余人；设有16个专业学院，开办56个本科专业。
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