土壤酸碱度对土壤肥力及植物生长影响很大，我国西北、北方不少土壤pH值大，南方红壤pH值小。所以要针对土壤来选用适合的肥料来中和土壤。
EM益生菌原液主要由光合细菌、乳酸菌和芽孢菌群组成，经过特殊工艺发酵而成。使用em菌原液在改良土壤中的表现：
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1）、改良土壤、培肥地力。有机肥料施入土壤后，有机质能有效地改善土壤理化状况和生物特性，熟化土壤，增强土壤的保肥供肥能力和缓冲能力，为作物的生长创造良好的土壤条件。
除了使用em菌肥来改良土壤外还要做到以下几点：
2）合理耕作。合理耕作及时松土，可减少蒸发，破除板结，改善通气，抑制返盐，利于种子萌发和根系吸收。
3）植树造林。能降低风速，减少蒸发，减轻地面返盐
4）除盐土。在春秋旱季，将含盐表土刮除，移出耕地外，降低土壤含盐量。
5）开沟躲盐。是利用盐往高处走的规律，降低沟底含盐量，以利种子出苗。
6）放於压碱。把含泥沙较多的河水，引入事先筑好埂坝的地块，使泥沙降下来，於地改碱。
