在野外，鳄龟是水栖龟类，生活于淡水中，如湖、河、沼泽地及水潭，也可生活于含盐较低的咸水中，如港湾、河口湾。喜伏于水中的泥沙、灌木、杂草中。鳄龟漂浮在水中时，借助其背甲上保护色——像一块烂木头漂浮在水中，很不容易被发现。它时常将眼鼻伸出水面外，而头不完全伸出。鳄龟喜白天在水中，伏在木头或石块上，有时也漂浮在水面，有时四腿朝上，背甲朝下，头却朝上露出水面。夜晚龟开始爬动，鳄龟不怕寒冷，不惧炎热。环境温度18°C以上正常觅食，20～33°C是最佳活动、觅食的温度，34°C以上少动，伏在水底及泥沙中避暑，15～17°C时尚能少量活动，有些龟能觅食，15°C以下冬眠，10°C以下深度冬眠。
