天然生物除臭剂表面不仅能有效地吸咐、分解空气中的恶臭气体分子，同时也能使被吸附的异味分子的立体构型发生改变，削弱了异味分子中的化合键，使得异味分子的不稳定性增加，容易与其他分子进行化学反应，植物液中的酸性缓冲液发生反应，最后生成无味、无毒的有机盐。如化合物在植物液的作用下反应生成硫酸根离子和水；氨在植物液的作用下，生成氮气和水。天然生物除臭工作液中所含的有效分子是来自于生物酶本体，它们大多含有多个共轭双键体系，具有较强的提供电子对的能力，这样又增加了异味分子的反应活性。吸附在天然生物除臭工作液表面的异味分子与空气中的氧接触，此时的异味分子因上述两种原因使得它的反应活性增大，改变了与氧反应的机理，从而可以在常温下与氧发生反应。
